它被用作许多应用使用如MS的Visual Studio，飞马等。然而，在这种格式中，.pdb文件通常不能由比它安装的应用程序的其他只是任何应用打开了一个程序数据库文件类型。 

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此文件扩展名被用作Palm桌面数据库文件，其中它也被用来通过掌上basedPDA设备。这些文件包含各种信息。它们可以是电子表格，数据库，图像等

该.pdb文件是在蛋白质数据库文件格式的文件;研究蛋白质这就是为什么这些文件大多采用由研究协作实验室对结构生物信息学的结构时使用的格式。 

 .pdb文件扩展名用作PowerDesigner的数据库使用，其中这些.pdb文件引用的数据，这个数据库保存，以及它们还含有其他文件引用PowerDesigner的数据库备份文件。 

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